水龙骨纲是木贼门(有胚植物)木贼亚门(维管植物)的一个纲。按PPG I系统的定义,它相当于狭义蕨类(链束植物)。多识植物界系统未采用起名,而是代之以木贼纲(Equisetopsida)。
水龙骨纲的学名Polypodiopsida由多足蕨属(属水龙骨科)学名Polypodium的复合形式Polypodi-加上表示有胚植物的纲的等级后缀-opsida构成。该词为复数形式,故在做主语时应与动词的复数形式搭配。
本纲中文名由“水龙骨科”一名中的专名“水龙骨”加上“纲”字构成,最终来自于水龙骨科中文名的基名属水龙骨属(Polypodiodes)。